Das NZXT M59 hat die Maße 190x449x508 mm (B x H x T) und wiegt 6,5 kg, womit es die üblichen Maße eines Midi-Towers einnimmt.
Das linke Seitenteil verfügt über ein großes Fenster mit einem verbauten 120-mm-Lüfter. Das rechte Seitenteil besitzt bis auf einen Eingriff zum leichteren Öffnen keine Besonderheiten. Da das linke Seitenteil keinen Eingriff und auch hinten keine Aussparung besitzt, ist es etwas umständlicher zu öffnen.

Die Front ist dynamisch, leicht wellenartig geformt und nicht eben. Sie besteht bis auf die oberen Laufwerksblenden und dem Panel in der Mitte aus feinem Lochgitter, welches mit Staubfiltern versehen ist. Durch die mitgelieferte schwarze Laufwerksblende lassen sich auch Laufwerke, die keine schwarze Front besitzen, in dem Gehäuse verbauen, ohne die Optik zu zerstören. Das Panel in der Mitte besitzt neben Power- und Resetknopf Anschlüsse für Kopfhörer, Mikrofon, eSATA und zweimal USB.
Die Oberseite ist sehr schlicht gehalten und besitzt bis auf Lüftungslöcher für zwei 120- oder 140-mm-Lüfter keine Besonderheiten.

Das Netzteil wird beim NZXT M59 untem im Gehäuse verbaut. Über dem Netzteil befinden sich die Slotblenden und neben dem Platz für die Mainboardblende der schon vorinstallierte 120-mm-Lüfter. Ganz oben gibt es noch zwei Ausgänge für die Schläuche einer Wasserkühlung. Beide Seitenteile werden mit Thumb Screws verschlossen.